Es sabido que los profesores tienen a su cargo conducir el rumbo académico de una institución educativa. Sin embargo, las nuevas maneras de enseñar y hacer investigación limitan que los profesores funcionen como individuos aislados y que se prefiera el trabajo colegiado o grupal, sobre el individual, para propiciar la necesaria vinculación de la generación y aplicación del conocimiento con el exterior de la institución. Por ello, la Secretaría de Educación Pública (SEP), a través del Programa de Mejoramiento del Profesorado (PROMEP) promueve la formación de cuerpos académicos de profesores, grupos académicos que les permiten reflexionar sobre los objetos de estudio y sobre el avance de las disciplinas y hacer un trabajo más eficiente. Los cuerpos académicos son grupos de profesores-investigadores de tiempo completo que comparten una o varias líneas de generación y aplicación innovadora del conocimiento (investigación o estudio) en temas disciplinares o multidisciplinares y un conjunto de objetivos y metas académicos destinados a la generación y/o aplicación de nuevos conocimientos (Diario Oficial de la Federación, tercera sección, acuerdo 417 del 30 de diciembre de 2007).
En congruencia con los planteamientos de la SEP-PROMEP, en el año 2002 los profesores del Campus de Ciencias Biológicas y Agropecuarias conformaron Cuerpos Académicos. Éstos atienden los programas educativos de la institución (Licenciatura en Agroecología, Licenciatura en Biología, Licenciatura en Biología Marina, Licenciatura en Medicina Veterinaria y Zootecnia, Maestría en Producción Ovina Tropical, y Posgrado Institucional en Ciencias Agropecuarias y Manejo de Recursos Naturales Tropicales) además de realizar labores de investigación, difusión y vinculación, para dar cumplimiento cabal de las funciones de la dependencia y de la Universidad. Actualmente el CCBA cuenta con nueve cuerpos académicos.

• Apicultura Tropical.


• Bioecología Animal.


• Diversidad de los Recursos Florísticos de Mesoamérica.
  
• Ecología Tropical.


• Manejo y Conservación de Recursos Naturales Tropicales.


• Producción Animal en Agroecosistemas Tropicales.


• Recursos Marinos Tropicales.


• Reproducción y Mejoramiento Genético Animal en el Trópico.


• Salud Animal.